海洋馆的建造比一般的建筑有着特殊的存在，它不像考虑一般的建筑结构那么简单。海洋馆的建造更加考虑了生命支持系统和回收设备。主要体现在展品的技术设备和展品的维护上。海洋馆底层大部分为水体，如表演池、游泳池、鲨鱼池、鲸鱼池、养护池、蓄水池、火池等，各部分水体要求的清洁度身体、温度、深度和成分（主要是海水和淡水）有很大的不同，因此用于水处理的巨大机械和电气系统构成了水族箱设备和技术的主体。水族馆建筑的很大一部分被设备占据（约占总建筑面积的10%）。除了一般建筑所需的配电、制冷、消防、通风、照明等系统外，最重要的设备系统是水处理系统（包括生命维持系统）。

海洋动物的保护和医疗也是水族项目需要考虑的必要设施。针对不同的动物和不同的疾病，必须分开，甚至单独分开。动物医院的位置很重要。展厅的设计既要与海洋馆保持隔离，又要方便快捷。为此，需要在动物展示与表演、保护与医疗三个区域之间设置地下通道，并合理设计和配置通道内水体的循环、标高和水质。动物的展示需要大量的透明材料，不仅要具有良好的透光率、清晰度、变形小，还要能承受巨大的水压。壁式和圆筒式海洋动物展示体，水族箱的外包装结构，一般有两三层的高度，巨大的水压要求展示体的壁厚在0.5m以上，普通玻璃很重又不是很安全，所以大部分海洋馆内都是使用亚克力材料。

海洋馆建造空间处理应根据水族的物理功能要求，如温度、湿度、通风等，确定每个区域不同的层高变化；为了保证海洋动物的日照时间，要合理设置屋顶开度和采光，而这往往与室内温湿度的处理相矛盾。这部分的机械动作，即水族箱的生命维持系统，完全由电脑自动控制。